Podstawowy typ Fotokodu nie powinien być mniejszy niż 2x2cm. Mogą być problemy z odczytaniem małych Fotokodów z monitorów CRT, ze względu na odświeżanie obrazu w monitorze. Odświeżania objawia się „pływającymi pasami na ekranie” widocznymi w kamerze, często skutecznym sposobem jest zmiana parametru odświeżania na monitorze. Odświeżanie również może być przeszkodą przy odczytywaniu kodów z obrazu niektórych starszych modeli projektorów multimedialnych. Można spróbować zwiększyć jakość skanowania zwiększając chwilowo kontrast monitora.

Przy odczytywaniu Fotokodu należy zwrócić szczególną uwagę na prawidłowe oświetlenie kodu najlepiej światłem koloru białego. Kolory, które zostały użyte do wydrukowanie/wyświetlenia kodu powinny być kontrastowe (standardowo jest to czerń i biel).

Niektóre modele telefonów (np. Nokia N70 i Nokia6630, Nokia 6680) same automatycznie rozpoznają Fotokod bez konieczności robienia zdjęcia. Wystarczy najechać kamerą i kod zostanie po chwili sczytany i zdekodowany. W przypadku tych telefonów sczytanie kodu oznacza automatycznie jego rozpoznanie i przystąpienie do dekodowania.

W telefonach z aplikacją Java nalezy każdorazowo o rozpoczęcie przechwytywania a następnie o zaakceptowanie odczytania Fotokodu przy użyciu kamery, po prostu trzeba zrobić zdjęcie.